何异议，毕竟日本大约有一半的天皇是名望家族出身的嫔妃之子。然而，昭和天皇认为不符合目前日本在现代社会极欲扮演的角色，因而加以拒绝。1933年12月23日，日本入侵中国的同一年，昭和天皇夫妻的坚持总算有了结果，明仁诞生了。那时，国旗飘扬，喜铃齐响，烟火欢腾，举国同庆。

皇室孩子的成长过程中总是缺乏家庭的爱。明仁出生后一个多星期就离开了父母，由奶妈哺乳照顾，在皇宫的育儿院长大。3岁时，他被带回自己的宫殿，交由私人教师、内侍及保姆共同养育长大。只有每周一次的正式会面与包括新年的庆典，才会和父母与其他手足见面。紫禁城墙内，中国的末代皇帝溥仪也是在类似的孤立环境下，由太监照料长大，他写道：“虽然我有很多位母亲，我却从来不知母爱为何物。”一名日本亲王曾告诉作家河原敏明：“当我母亲过世时，我一滴眼泪也没流；但当我的侍女辞职时，我非常难过以至于无法停止哭泣。”

明仁的整个童年生活都是在战争中度过。一开始，日本的军队战无不胜、攻无不克，从澳大利亚的达尔文、斯里兰卡，到遭受日本氢气炸弹攻击的美国本土，步步前进。然而，到了1944年，李梅将军（Curtis LeMay）以B29轰炸机空袭日本，造成的死伤人数甚至超过广岛和长崎加起来的原子弹受难者。明仁和弟弟常陆宫亲王撤退到日光市的避暑别墅避难。在他12岁时，他的父亲在电台广播中，以一贯委婉的口气宣布“战争目前的发展局势已对日本毫无利益可言”，于是日本投降了。