王坐镇督查该案，并由刑部、吏部、礼部、都察院一起组成专案组查案。

嘉庆十四年（一八〇九年）七月，案情大白：李毓昌等一行查赈大员来到了山阳。王伸汉恐贪污赈银之事败露，即贿赂查赈人。李毓昌这个忠厚耿直的山东汉子严词拒绝。为了避嫌，他不住王伸汉为之安排的县衙公馆，而选定了城郊的善缘庵作为寓所。山阳县共辖四十乡，每乡数十村。李毓昌带人一村村核对人数及所领赈银。一个月内复查二乡毕，将所查出的王伸汉借放赈之机贪赃枉法、克扣赈银之事造册欲上禀淮安知府。这样查下去，王伸汉的贪腐肯定会败露。

一不做二不休，王伸汉用五百两银子买通了李毓昌身边的仆人李祥、顾祥、马连升，然后宴请李毓昌，李推脱不过，王伸汉频频敬酒。喝高了的李毓昌回寓所休息，因酒后口渴，唤仆上茶。李祥趁机将毒药放于茶内，失去警惕的李毓昌一饮而尽。然后毒发吐血，三个恶仆将奄奄一息的主人勒死，伪造自缢假象，然后报告当地官府。王伸汉知道后大喜，派人先将李毓昌准备向府署呈送的呈状及户口清册取走，然后派人将案情报知淮安府。但百密必有一疏，他没来得及仔细清查李的遗物，没想到李毓昌担心被害，早有遗书缝在衣服内。淮安知府派办案人员前来查验，王伸汉便暗中送与白银二千两，淮安知府王毂收了银子后，心知肚明。于是，李毓昌因抑郁症“自杀”的报告出笼了，报到省府，管司法的按察使也睁一只眼闭一只眼。